Несмотря на то, что правительству удалось подавить вооруженное выступление народных масс, их борьба нанесла сильный удар по боярско-княжеской реакции. После событий 1547 г. не могло уже быть и речи о сохранении того положения в государстве, при котором политическая власть оказывалась безраздельно в руках реакционного боярства. Правительство Глинских пало. Боярство само должно было искать соглашения с дворянством, тоже напуганным поднявшейся волной антифеодальных народных движений. В страхе перед народными массами обе враждующие группировки феодалов искали соглашения друг с другом, компромисса. Не прекратившиеся и после 1547 г. антифеодальные выступления народных масс укрепляли боярство и дворянство в этом настроении. В известной мере относительная прочность компромисса между боярством и дворянством была обусловлена и недостаточной степенью политической организованности дворянства, что открывало возможность для попыток наиболее реакционных групп боярства при первом же удобном случае вернуться к положению, существовавшему в 30-х — первой половине 40-х годов.
В целях политической консолидации всех прослоек класса феодалов в феврале 1549 г. был созван в царских палатах в Москве земский собор, так называемый «собор примирения», в котором принимали участие представители духовенства, боярства и дворянства. Тем же целям в основном служил созыв церковного «Стоглавого» собора в феврале 1551 г. «Стоглавый» собор утвердил новый Судебник.
Оба собора были тесно связаны с проведением реформ, направленных на укрепление централизованного Русского государства. Конкретным проведением этих реформ в жизнь руководило новое правительство — так называемая «Избранная рада», являвшаяся правительством компромисса между боярством и дворянством. Компромиссный характер нового правительства отчетливо виден и по его составу. Во главе «Избранной рады» оказались думный дворянин А. Ф. Адашев, происходивший из незнатного дворянского рода, и священник придворного Благовещенского собора Сильвестр. Ни тот, ни другой не были сторонниками решительного разгрома боярства и искали союзников среди родовитой знати. Наиболее дальновидные представители боярства, признававшие перед лицом подымающегося антифеодального движения народных масс необходимость уступок дворянству и укрепления центральной власти, примкнули к Адашеву и Сильвестру и приняли участие в деятельности «Избранной рады». В их числе были князья Д. И. Курлятев, Д. Ф. Палецкий, М. И. Воротынский, И. Ф. Мстиславский, тогда еще очень молодой А. М. Курбский и некоторые представители нетитулованного московского боярства.
Реформы 50-х годов XVI в., проводимые правительством «Избранной рады», соответствовали в основном интересам дворянства и были направлены на укрепление аппарата центральной власти. Эти реформы вызывали ожесточенное сопротивление крайне реакционных групп боярства. Когда в марте 1553 г. царь Иван Грозный тяжело заболел, реакционное боярство попыталось произвести государственный переворот. Боярские заговорщики хотели устранить от наследования престола четырехмесячного сына Грозного царевича Дмитрия и возвести на престол двоюродного брата царя Владимира Андреевича Старицкою. Боярский «мятеж» 1553 г. был быстро ликвидирован. Но уже в 1554 г. был раскрыт заговор князей Лобановых-Ростовских. Следствие показало, что заговорщики стремились опереться в борьбе с центральной властью на враждебную Русскому государству Литву. События 1553 и 1554 гг. позволили Ивану Грозному укрепить курс на дальнейшую политическую централизацию государства. Одной из важнейших реформ, проведенных правительством компромисса, была судебная реформа, ограничившая суд кормленщиков, являвшихся обычно представителями знатнейшего боярства. Согласно указу 1549 г. дети боярские были освобождены от суда наместников и подчинены центральным судебным органам. Дети боярские получили право суда над своими крестьянами, за исключением случаев особо важных уголовных преступлений (убийство, разбой). Тем самым мелкие землевладельцы были уравнены в правах с представителями крупного землевладения. Издание в 1550 г. нового Судебника и выработка формуляра уставной земской грамоты подготовляли отмену системы наместнического управления и кормлений и замену ее выборными земскими органами местного управления. Отмена кормлений была проведена в 1555 г., после ликвидации боярского «мятежа» 1553 г. и раскрытия заговора Лобановых-Ростовских. С этого времени судом и сбором податей ведали избираемые посадскими людьми и черносошными крестьянами «излюбленные головы» или «старосты», при которых находились выбранные из состоятельных слоев населения целовальники (земские судьи) и «земские дьяки». В ведении старост и земских судей находилось только тяглое население. Крестьяне, принадлежавшие частным владельцам, подлежали суду своих феодалов. Служилые землевладельцы судились центральными судебными органами.
Другой важнейшей реформой была реорганизация правительственного аппарата, серьезно упрочившая авторитет центральной власти в стране. В 50-х годах оформляются центральные правительственные учреждения, ведавшие как внутренними, так и внешними делами государства — приказы с постоянным штатом дьяков. Основные приказы были оформлены именно в это время.
Проведение церковной реформы преследовало цель консолидации сил духовных феодалов при одновременной частичной секуляризации церковных земель в пользу дворянства. Вторая задача фактически не была разрешена. Были только приняты меры к прекращению быстрого роста церковного земельного фонда за счет земельного фонда светских феодалов. Зато другие мероприятия — создание единого пантеона русских святых, унификация обрядов и культа — способствовали укреплению православной церкви как надежного оплота феодального строя. В основном в интересах дворянства проводилась военная реформа. В середине 50-х годов было издано уложение, которое определило зависимость размеров службы служилых людей от величины их земельных окладов. Вотчина и поместье были уравнены в правах по отношению к военной службе. Считалось, что с каждых 100 четвертей (четверть около половины десятины) хорошей земли на службу должен был являться одни конный воин в полном вооружении. Военная служба была пожизненной и наследственной. Учет военных сил проводился на периодически устраиваемых смотрах дворян по уездам.
Последовательное проведение в жизнь этой военной реформы упиралось в недостаток годных для передачи в поместья дворянам земель. В 50-х годах XVI в. государственный земельный фонд и земельный фонд, находившийся в руках дворян, фактически не выросли за счет боярских и церковных земель.
Одной из важных реформ было испомещение (предоставление поместий) вокруг Москвы в 1550 г. 1071 детей боярских. Эта «избранная тысяча» должна была стать верной опорой царской власти.
В результате военных реформ 50-х годов Русское государство располагало 100-тысячной дворянской конницей.
Одновременно были приняты меры к созданию постоянных пехотных частей. Было создано стрелецкое войско, первоначально насчитывавшее 3 тысячи человек и разделенное на 6 «приказов» (полков) по 500 человек в каждом. В дальнейшем численность стрелецкого войска значительно возросла. Стрельцы были вооружены пищалями (гладкоствольные ружья) и бердышами. Больших успехов достигла в описываемое время и русская артиллерия. Русское государство располагало не только большими предприятиями по изготовлению пушек, ядер и пороха, но и хорошо обученными многочисленными кадрами артиллеристов. Во второй половине XVI в. в русской артиллерии было введено очень важное техническое усовершенствование. Пушки начали ставить на лафеты, что позволило успешно применять артиллерию в полевых боях. На очень высоком уровне находилось в то время русское военно-инженерное искусство. Русскими военными инженерами была разработана весьма эффективная новая система инженерного обеспечения атаки крепостей. В этих целях создавались перед осажденными крепостями специально оборудованные плацдармы для атаки, строились опорные пункты и подступы. Русские военные инженеры обладали высоким искусством обороны городов и крепостей, прекрасно владели техникой минно-подрывных работ. Достижения в области военно-инженерного искусства должны были сыграть особенно важную роль в годы Ливонской войны, в ходе которой задачи атаки и обороны крепостей имели большое значение.
Успехи русского военно-инженерного искусства в большой мере опирались на громадный, веками накопленный русскими инженерами опыт градостроительства.
Таким образом, к концу 50-х годов XVI в., накануне Ливонской войны, Русское государство являлось могущественнейшей военной державой в Европе. Современники-иностранцы могли с полным правом называть Грозного сильнейшим из европейских государей. Возросшей силы Русского государства опасались даже в Стамбуле, при дворе султана, грозы Германской империи. Вместе с тем в результате реформ 50-х годов Русское государство значительно окрепло, достигло значительно более высокой степени политической централизации, чем когда-либо прежде. Последнее не исключало, однако, того, что внутри Русского государства существовали условия, способные серьезно ослабить и затормозить его военные усилия.
Правительство «Избранной рады» в своей политике реформ в значительной степени отражало интересы дворянства. Дворянский характер реформ «Избранной рады» хорошо заметен на примере Судебника 1550 г. Идя навстречу мелким и средним землевладельцам-феодалам, Судебник подтвердил, что крестьяне имеют право выхода только в Юрьев день. При этом была повышена плата за так называемое «пожилое», следуемая феодалу с крестьянина. В случае ухода осенью крестьянин должен был заплатить дополнительно еще 2 алтына «за повоз», в счет отбываемой зимой повозной повинности. Постановление Судебника преследовало цель прекратить уход крестьян из дворянских поместий в вотчины бояр, князей и монастырей.
При всей своей продворянской направленности деятельность «Избранной рады» была противоречивой. Противоречия эти выражались прежде всего в том, что реформы в интересах дворянства и отчасти посада осуществлялись руками бояр и близких к ним по образу мыслей лиц. Противоречия эти заключались, далее, в том, что расширение политических прав дворянства в ущерб привилегиям феодальной знати, укрепление экономических основ дворянского землевладения происходили без сколько-нибудь серьезного подрыва экономической базы боярской реакции — крупного землевладения бояр и князей. Противоречия эти обусловливались в конечном итоге тем, что конфликт между дворянством и поддерживавшими его социальными верхами посада и боярством не был разрешен в 50-х годах XVI в. Он был только временно смягчен. Экономическое укрепление дворянского землевладения и политическая консолидация дворянства подготавливали переход дворянства в решительное наступление на крупных феодалов, которые, как это с полной очевидностью показали события 1553 и 1554 гг., должны были оказать отчаянное сопротивление политике дальнейшей централизации страны и подрыва их экономического могущества. При таких обстоятельствах резкое обострение конфликта между боярством и дворянством было неизбежно. В случае тяжелой и длительной войны это обострение внутриклассового конфликта между двумя группировками феодалов должно было оказать самое отрицательное влияние на развитие военных событий. Тяжелая и длительная Ливонская война не была, таким образом, подготовлена предварительным решительным политическим и экономическим разгромом реакционного боярства.